Créé en 1997 par Ben Falgoust et Zak Nolan sous le nom Acid Bath, les américains ont opté pour un style black metal. Suite à une démo de quatre pièces, deux autres membres se sont ajoutés. Il s'agit de Ben Stout de Soilent Green et Patrick Bruders. En 1998, ils ont mis en vente la démo "Serenades to the Tides of Blood" via Red Seas Productions. Goatwhore a mis en vente leur premier album, "The Eclipse Of Ages Into Black", en 2000 via Rotten Records, une compagnie locale de metal extrême en Louisiane, États-Unis. La même année, il y a eu l'ajout du chanteur Louis Benjamin Falgoust II. Entre 2000 et 2002, ils ont fait plusieurs tournées avec des groupes comme GWAR, Mortician, et Immolation. Plus les spectacles se multipliaient, plus les amateurs de USBM ont accroché à leur son. Le guitariste Ben Stout a décidé de quitter Goatwhore.




En 2003, l'album "Funeral Dirge For The Rotting Sun" est mis en vente sous Rotten Records, démontrant que le groupe est capable de continuer d'améliorer leur son. Après l'enregistrement, Tim Holsinger quitte la formation. Pendant la tournée avec Soilent Green, Ben Falgoust a été blessé dans un accident de voiture, ce qui l'a empêché de chanter durant les performances du groupe. Goathore a décidé de se retirer pour laisser Ben se rétablir.




Lors de l'année 2004, ils se sont rendus au Japon. Un peu avant, Zak Nolan a quitté le groupe et il a été remplacé par Justin Perez comme remplaçant en tournée. Ils ont fait l'ouverture de Dark Funeral et Zyklon. L'album "A Haunting Curse" a été mis en vente en 2006 par Metal Blade Records. Il a été enregistré au Mana Studios à St. Petersburg, Floride avec le producteur Erik Rutan. En 2006, le groupe est composé de Sammy Duet (vocal/guitare), Ben Falgoust II (vocal), Zack Simmons (batterie) et Nathan Bergeron (basse).